Inicía la seva carrera com a flautista debutant en el Festival de Salzburg amb «I Solisti Veneti”. Considerat com un dels exponents de la flauta de la seva generació, deixa la seva activitat concertística per a dedicar-se plenament a la direcció d’orquestra.
Alumne de Piero Bellugi, Conti aviat a ser nomenat director titular en diverses orquestres italianes i de l’estranger, i des de llavors dirigeix prestigioses orquestres i teatres a tot el món, variant del repertori simfònic a l’operístic així com ballets. Són nombroses els seus enregistraments per a alguns dels millors segells discogràfics internacionals.
Actiu en la divulgació i promoció dels diversos aspectes de la música culta, Marzio Conti ha format part amb freqüència de programes de televisió i ràdio, promovent, a més del repertori simfònic tradicional i l’operístic, la música contemporània amb participacions en importants retransmissions internacionals. Des del començament és la seva carrera com a director, Marzio Conti sempre ha ocupat càrrecs com a director titular i artístic en diverses orquestres italianes i estrangeres.
El seu darrer càrrec ha estat com a director titular de l’Orquestra Filharmònica d’Oviedo des de 2011 fins a 2017, rebent grans premis inclosos la prestigiosa Medalla d’Or Auditori d’Oviedo , considerat el màxim reconeixement artístic de la ciutat; entre altres coses en els últims anys ha estat diverses vegades Jurat de les Arts en els Premis Princesa d’Astúries.
En la seva carrera ha tocat dirigit i gravat amb alguns dels màxims exponents de solistes, cantants , directors d’escena, ballarins i coreògrafs de l’escena internacional.